Dispositif QTL hêtre

Dispositif cartographie génétique et QTL hêtre

Nouzilly (37) et Guémené Penfao (44)

Dispositif expérimental

Multi-site

Non

Non

Ce dispositif est composé de plusieurs familles de plein-frères (reconstituées grâce à un test de paternité), installées à Tours sur une parcelle proche de l'UE de orfrasière (Nouzilly 37) et à la pépinère de l'état de Guémené Penfao (44).

Fev. 2017 à Nouzilly, Janv.2019 à Guémené

0,63 ha à Nouzilly, 0,5 ha à Guémené

Fagus sylvatica

Génotype (test de paternité et RNAseq) et phénotype (débourrement, mortalité, croissance); uniquement sur les descendants plantés à Nouzilly

Filets pour quantifier la reproduction de l'arbre mère MSSB à Saint- Symphorien (33)

Survie, hauteur, phénologie (INRAE)

Données séquencées au CEA (Génoscope) -projet France Génomique BEECHGenome

*6 RNA-Seq de l'accession MSSB : https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB46583?show=reads
*Unigene : https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/HBVZ01000000
*200 RNA-Seq : https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB46593?show=reads

INRAE

C Plomion et C Bodénès

UE orfrasière d'INRAE Nouzilly

ONF Guéméné Penfao

-articles : 1/ carte génétique construite pour valider l'assemblage d'un 1er génome du hêtre (accession BAGHA) en 12 pseudomolécules https://doi.org/10.3389/fgene.2021.691058 ; 2/ génome de référence de MSSB à venir. Il est actuellement utilisé dans le cadre de deux projets (étude génétique sur les faux de Verzy coord. C Plomion et étude de l'adaptation du hêtre coord. I Scotti, en partenariat avec le Génoscope, JM Aury) ; 3/ les données de RNAseq pourront servir à une étude eQTL.